Можете, но это может повлиять на длительность эксплуатации жёсткого диска.

Вентилятор ставиться по большей мере для охлаждения жёсткого диска. Это вам решать отключать или нет... От этого может зависеть продолжительность эксплуатации, если регистратор стоит в очень тёплом непроветриваемом помещении.